BLASTN 2.2.3 [May-13-2002]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= BA0AB009A04LP1|AL425959
(862 letters)
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
1807 sequences; 10,358,551 total letters
Searching....done
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Sbjct: 4174 aattaccagttgcagagggaaacatgtgaaaggccttcctcaccaccggccctcatgctg 4115
Query: 653 gtcatttatgcagtcgtgttgtcaagttctagatccaaagattcaaattcactcttcttt 712
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Query: 713 tttcatcaaaataaatgactttttattatcagagtgttccaataggagagagtgatatac 772
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Sbjct: 4054 tttcatcaaaataaatgactttttattatcagagtgttccaataggagagagtgatatac 3995
Query: 773 cctataactcatcagcgaatgttccgacgtatctccttcggagtatagcgttattcagta 832
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3994 cttataactcatcagcgaatgttccgacgtatctccttcggagtatagcgttattcagta 3935
Query: 833 gcctcattactaggtacggtaagtattggg 862
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Sbjct: 3934 gcctcattactaggtacggtaagtattggg 3905
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
Posted date: Nov 27, 2002 12:23 PM
Number of letters in database: 10,358,551
Number of sequences in database: 1807
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
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effective search space used: 8738874594
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A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.8 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 50 (99.8 bits)